Virgo Versus the Zodiac est un JRPG de science-fiction/fantaisie inspiré des séries Mario & Luigi RPG et Mother RPG dans lequel vous incarnez un méchant fanatique.
Le jeu propose un combat traditionnel au tour par tour avec une exécution en temps réel des mouvements : bloquer, contrer et synchroniser vos attaques avec soin ainsi que prévoir les mouvements de vos ennemis est essentiel pour réussir dans la quête cosmique retorse et impitoyable de Virgo pour ramener l'Âge d'Or, une période de paix, de symétrie et d'équilibre, ou du moins c'est ce qu'elle pense.
Dans cette galaxie où chaque action entraîne une réaction, vous incarnerez la Vierge, la Reine sacrée, souvent appelée Reine Redoutable par les hérétiques, qui sème la pagaille dans les royaumes zodiacaux en laissant une traînée de poussière d'étoiles sur son passage, tout cela pour satisfaire sa vision excessivement vertueuse du monde.